L’assemblée générale, le conseil d’administration et le bureau sont les trois instances qui fixent les orientations stratégiques, le cadre d’action et le budget de l’association. 

Conseil d'administration

L’association est dirigée par un conseil d’administration présidé par le président de Saint-Nazaire Agglomération, M. David Samzun.
Le conseil d’administration trace les orientations de l’association. Il délibère notamment sur le budget, le rapport d’activités et le compte-rendu de la gestion financière qu’il présente à l’assemblée générale ordinaire.
Il prend les décisions nécessaires sur le rapport du directeur quant à la gestion financière de l’association et l’organisation de l’équipe pluridisciplinaire de travail.

Assemblée Générale

L’assemblée générale ordinaire se réunit au moins une fois par an, sur convocation du président. Elle est composée de l’ensemble des représentants des membres de l’association.
L’assemblée générale ordinaire règle par délibérations les affaires de l’association. Elle approuve notamment le budget, le rapport d’activités et le compte-rendu de la gestion financière de l’association qui lui sont présentés par le conseil d’administration.
De son côté, l’assemblée générale extraordinaire se réunit pour délibérer sur la modification des statuts.

Bureau

Le bureau est une instance de débat sur les orientations stratégiques de l’agence. Il réunit autour du Président de l’association, les exécutifs de l’ensemble des membres publics de l’association disposant d’au moins un représentant au conseil d’administration.